依「植物品種及種苗法(以下簡稱種苗法)」第52條及第54條規定，基因轉殖植物非經中央主管機關許可且通過田間試驗審查，並檢附經中央目的事業主管機關核准之同意文件(依其申請用途而異，如食用需向衛生福利部，如為飼料需向農委會申請)，不得在國內推廣或銷售。違反前開規定逕行推廣或銷售者，處新臺幣一百萬元以上五百萬元以下罰鍰；非法推廣或銷售之植物，得沒入銷毀。
我國僅許可部分基因改造食品及飼料(如大豆、玉米)之上市，但迄未許可任何基因轉殖植物之種植及推廣銷售，請種苗業者及相關業者留意避免違法。